去年十一月，雅典暨全希腊总主教（Archbishop of Athens and All Greece）希罗尼穆斯二世（Ieronymos II）与希腊总理兼激进左翼联盟领袖齐普拉斯（Alexis Tsipras）就政教分离达成初步协议。管理希腊正教会的希腊正教圣主教会（The Church of Greece Holy Synod，下称「圣主教会」）在三月十四日起举行为期三日的紧急会议，就此协议商讨。
希腊全部八十二名主教认为圣主教会需要得到他们的授权，才可和政府就政教分离协议进行磋商，当中具争议性的部份——希腊政府将不再支付八千七百名神职人员的薪金，但仍会以补助的形式支付薪金。身为无神论者的齐普拉斯表示，这笔款项可用于在大选时期聘用一万名公务员。
希腊正教会和管有部份希腊教区的君士坦丁堡普世牧首区（Ecumenical Patriarchate in Constantinople）都反对上述条款，消息人士向希腊报章Kathimerini指由政府支付神职人员薪金是教会的底线。
政府坚持指，教会要不接受协议内所有条款，要不放弃这份协议。齐普拉斯认为教会没有选择，而这个方案是他的要求。去年与齐普拉斯在原则上达成共识的希罗尼穆斯二世则表示，由于国会就政教分离协议投票前，须得到教会签字同意，因此他支持有关神职人员有关工资变动的决定。
希腊九成八人口信奉希腊正教，希腊正教亦是获宪法承认的国教。希腊正教会主教长为雅典及全希腊总主教。教会辖区限于一九一二至一三年巴尔干战争之前的希腊领土内，剩馀部份则为君士坦丁堡普世牧首区辖区，但实际上剩馀部份的教区大多由希腊正教会所管理。在政教合一的希腊，现在约有一万名左右的希腊正教会的神职人员及教会事奉人员被视为公务员，他们的薪资也会被列在政府的薪资支付名册上。根据路透社估计，政府每年需要支付约两亿欧元的薪资给他们。若新协议通过，希腊正教会的神职人员将不再被视为公务员，而他们的薪水会转以国家补助的方式支付。正教会须先取消近万名教会人员的公职身份，以此让希腊政教分离迈进一步。
