拉丁美洲多國天主教會暫停實體彌撒，但福音派繼續實體聚會及進行外展事工，加上政府防疫訊息混亂，甚至不設防，以致信徒和教牧染疫者眾。重災區之一玻利維亞，有上百位牧者死於新冠肺炎，有些堂會三成會眾確診。
傳統上拉美以天主教徒居多，近年福音派著力開拓禾場，許多堂會輕視政府的防疫指引，仍實體崇拜，同工繼續探訪等事工。在玻利維亞，即使教堂被勒令提早關門，不少牧者仍密切接觸會眾，支援病者。全國基督教協進會的阿魯基帕牧師（Luis Aruquipa）表示已有上百位牧者病逝：「他們去祈禱、探病，就在服侍中染疫亡。」亡者之一是七十九歲的福音派教會聯盟（Evangelical Churches）創辦人阿里斯門迪（Roberto Arismendi），包括兒子查維亞（Javier Arismendi）在內，全家八口都被他感染，但已康復。查維亞說：「我們不曉得他何時染疫，但他把病毒帶入全家。」「先父從沒停止幫助人，他總親近他的會眾，給他們信心、食物和平安。」玻利維亞九月初已近十二萬人確診，在拉巴斯的平民社區，一家中型堂會有三成人即近百人染疫。
另一個重災國家尼加拉瓜，自三月以來，至少四十四位福音派教牧染疫身亡，其中兩位是六月五日病逝、首都馬拿瓜（Managua）伯特利復興會（Bethel Restoration church）的牧者。「現存太多錯誤資訊，」死者之一華拉達里斯的兒子魯爾（Raúl Valladares）接手牧養工作：「單是我們宗派，約有二十位牧者死亡。伯特利有一位牧者、先父和廿五位會友死於新冠肺炎。」但他相信他們並非崇拜時感染。伯特利復興會疫中一直開放，直至神召會尼加拉瓜大會要求屬會五月中即時關閉。當地福音派大小堂會爆疫初期照常開門，因政府淡化疫情，仍舉行大型活動，學校不停課，球季如常。總統奧爾特加（Daniel Ortega）跟巴西總統博爾索納羅（Jair Bolsonaro）都認為，國家輸不起停擺。
巴西有新五旬宗（neo-Pentecostal）的領袖主張神蹟醫治，或宣稱新冠肺炎是要殺死小信者的瘟疫，堅持實體崇拜。他們是總統博爾索納羅（Jair Bolsonaro）的忠實支持者，得總統撐腰。博爾索納羅指疫情下宗教活動是必須的，三月還容許教會開放，教牧活動不受限；不過有些州份自行推出防疫措施。偏遠的查瓦利溪谷（Javari Valley）保護區，原住民領袖馬魯波（Beto Marubo）批評疫中實體崇拜危害居民：「有信徒參加完北阿塔拉亞（Atalaia do Norte）的崇拜，把病毒帶來我們的土地。」
踏入八、九月，拉美多處會眾重新實體崇拜。在尼加拉瓜馬薩亞（Masaya）一間教會帶領敬拜的甘保斯（Maynor Campos）說：「我們活在艱難時代，不單我們的國家被衝擊，全球皆是，現在是時候尋求神臨在。」在那教會裡，七十位會眾不戴口罩跟樂隊又唱又叫，沒幾個人進場前洗手，並非人人嚴謹防疫。
