巴西自三月出現新冠肺炎個案開始，其國家原住民基金會便下令除醫護人員或糧食分配員等必要工作者外，其餘平民一律須離開原住民保留區，惟該國總統博索納羅（Jair Bolsonaro）在七月七日簽署新法，只要基督教傳教士獲由醫生簽發的健康證明表格，即可以用必要工作者的身份留守原住民保留區。有原住民組織質疑此舉，認為新法例將促使傳教士進入原住民保留區，並對當地原有文化造成破壞。
據當地報章O Globo報道，國際前線宣教團（Frontier International Mission）的成員早於去年就曾試圖前往查瓦利河（Javari）的支流之一伊塔科伊河（River Itacoaí）。據其網站所指，該組織的目標之一就是「前往世界各地福音未及的原住民群體（unreached Indigenous people groups）開展宣教工作」。另外，巴西總統博索納羅於今年二月亦曾因任命福音派牧師兼人類學家迪亞斯（Ricardo Lopes Dias）管理原住民事務而引發爭議。
今年四月，巴西查瓦利溪谷（Javari Valley）原住民協會（UNIVAJA）就曾提出訴訟，將數名傳教士逐出該地。該會其中一位協調員馬魯博（Beto Marubo）認為新法例是獲福音派支持的總統博索納羅的精心策劃，旨在給予傳教士涉足原住民保留區的機會，最終讓地主成功佔據該地。他指出在上世紀四十年代的亞馬遜橡膠熱潮時期就曾有不少原住民因此喪生，擔心新法例會影響該地一向受巴西政府保護的文化、原住民的自決權利，甚至他們的性命會因此遭受損害。他更稱：「只有被他們（傳教士）所迷惑（catechized）的原住民才會不反對他們存在」。
曾在四月被逐出查瓦利溪谷的國際前線宣教團成員、在亞馬遜居住了十三年的托金（Andrew Tonkin）則反對上述說法。他指自己是獲當地政府准許，協助改善原住民保留區居民的生活。他強調自己僅以耶穌基督的救贖力量為原住民充權（empower），而非對他們進行任何形式的宣教工作，反指原住民組織未有保障原住民的信仰自由，以及邀請他人進入其所住社區的權利。對此，他直指自己正在進行一場「對抗邪惡與黑暗的精神鬥爭」。國家原住民基金會創辦人悉尼波蘇埃洛（Sydney Possuelo）表示，傳教士慣以送贈禮物（如原住民急需的鐵製工具）的形式吸引原住民接受講道，藉此改變他們既有的信仰習俗。
然而，亦有與原住民團體合作長達數十年的基督教團體認為，福音派傳教士對促使原住民轉宗的興趣遠超於對他們伸出援手。路德會服侍善工基金會（Lutheran Diakonia Foundation）項目顧問詹迪拉凱皮（Jandira Keppi）表明傳教士應根據當地憲法尊重原住民的靈性（spirituality）；天主教原住民牧靈委員會（Indigenous Missionary Council）助理祕書克萊伯巴扎托（Cleber Buzzato）亦同意外來人士在未經原住民同意下不應主動接觸他們。
